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TBE-尿素-PAGE電泳可以選擇RTM501 單鏈DNA Marker(25-75 nt)和RTM506 單鏈DNA Marker (15-120nt)作為分子量標(biāo)準(zhǔn)。
DNA尿素PAGE電泳試劑盒
DNA Urea PAGE Electrophoresis Kit
貨號(hào) |
名稱(chēng) |
規(guī)格 |
RTE4102 |
DNA尿素PAGE電泳試劑盒 |
60次 (1mm厚12%膠) |
● 產(chǎn)品組成:
貨號(hào) |
名稱(chēng) |
規(guī)格 |
保存條件 |
AC2914-01 |
40%PAA(29:1) |
100 ml |
4℃ |
TB002 |
10×TBE |
500 ml |
RT |
RU5080 |
尿素(電泳級(jí)) |
220 g |
RT |
AP020P |
APS(干粉) |
5 ml |
RT (配制后-20℃貯存) |
TA0761-01 |
TEMED |
0.5 ml |
4℃,避光 |
DL080-01 |
2×TBE尿素上樣緩沖液 (尿素變性膠) |
1 ml |
4℃ |
● 產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
DNA尿素 PAGE 電泳是研究寡核苷酸電泳的重要研究手段??梢詸z測(cè)2-500堿基的寡核苷酸片段,理論上可以分辨出相差一個(gè)核苷酸的片段。
本公司提供的DNA尿素PAGE電泳試劑盒包含凝膠制備及電泳所需的全部試劑,用戶(hù)只需自備制膠器具和蒸餾水,即可配制各種濃度的PAGE膠,使用方便。
按照每次制備7 ml 10%凝膠(大小10×8cm,1mm厚度)計(jì)算,試劑盒可使用至少60次。
● 貯存和運(yùn)輸:
試劑盒按照標(biāo)簽溫度貯存,有效期一年。試劑盒常溫運(yùn)輸。
● 使用說(shuō)明:
一、制備凝膠:
10% APS配制-5 ml:
將0.5 gAPS干粉溶于5 ml滅菌水中,徹底溶解后分裝,1 ml/支,-20℃?zhèn)浯?,每次取一管使用?0% APS應(yīng)盡量減少室溫存放時(shí)間,以防失效。10%APS在4℃有效期為一周,-20℃有效期12個(gè)月。若發(fā)現(xiàn)凝膠聚合時(shí)間延長(zhǎng),應(yīng)考慮更換使用-20度保存的10% APS。
1.1.參照凝膠模具說(shuō)明書(shū),裝配好凝膠模具。
1.2.分離膠配制:根據(jù)表格一,將不同體積的成分混合,漩渦攪拌至尿素徹底溶解。
表一 TBE-尿素PAGE分離膠配方表 (總體積5 ml,適用于厚度1.0 mm小板膠)
單鏈DNA長(zhǎng)度 |
最佳凝膠濃度 |
尿素(克) |
40%PAA (29:1) |
10×TBE |
補(bǔ)水到總體積 |
10%APS |
TEMED |
200-1000 nt |
5% |
2.1克 |
0.625 ml |
0.5 ml |
5 ml |
50 μl |
5 μl |
50-400 nt |
8% |
2.1克 |
1 ml |
0.5 ml |
5 ml |
50 μl |
5 μl |
40-350 nt |
10% |
2.1克 |
1.25 ml |
0.5 ml |
5 ml |
50 μl |
5 μl |
30-300 nt |
12% |
2.1克 |
1.5 ml |
0.5 ml |
5 ml |
50 μl |
5 μl |
10-150 nt |
15% |
2.1克 |
1.875 ml |
0.5 ml |
5 ml |
50 μl |
5 μl |
8-120 nt |
20% |
2.1克 |
2.5 ml |
0.5 ml |
5 ml |
50 μl |
5 μl |
1.3在凝膠模具中灌入適量分離膠溶液(對(duì)于mini-gel,凝膠液加至約距前玻璃板頂端1.5 cm或距梳齒約0.5 cm即可),然后在分離膠溶液上輕輕覆蓋一層1-5 cm的水層,使凝膠表面保持平整。
1.4靜置10-20分鐘,待分離膠和水層之間出現(xiàn)一個(gè)清晰的界面后,說(shuō)明凝膠已聚合。
注:凝膠的聚合時(shí)間與環(huán)境溫度有關(guān)。夏天溫度較高時(shí),聚合較快;冬天氣溫低時(shí),聚合時(shí)間會(huì)延長(zhǎng)??梢愿鶕?jù)環(huán)境溫度的不同調(diào)節(jié)APS的加入量。
1.5去除覆蓋在分離膠上的水層;按照表二將不同體積成分在一個(gè)小燒杯中混合;最后加入10%過(guò)硫酸銨和TEMED,輕輕攪拌使其混勻,避免產(chǎn)生氣泡。
表二 TBE-尿素PAGE 4%濃縮配方表 (總體積2 ml,適用于1.0mm厚度膠)
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各組份體積(ml) |
|||||
凝膠濃度 |
尿素 |
40%PAA(29:1) |
10×TBE |
滅菌水 |
10%APS |
TEMED |
4% |
0.84克 |
0.2 ml |
0.2 ml |
補(bǔ)水2 ml |
20 μl |
2 μl |
1.6將濃縮膠溶液加至分離膠的上面,直至凝膠溶液到達(dá)前玻璃板的頂端;將梳子插入凝膠內(nèi),避免產(chǎn)生氣泡。
1.7靜置30-60分鐘,等待濃縮膠聚合。
注:凝膠的聚合時(shí)間與環(huán)境溫度有關(guān)。夏天溫度較高時(shí),聚合較快;冬天氣溫低時(shí),聚合時(shí)間會(huì)延長(zhǎng)??梢愿鶕?jù)環(huán)境溫度的不同調(diào)節(jié)APS的加入量。
二、電泳:
2.1. 預(yù)電泳:拔出梳子,用1×TBE緩沖液徹底沖洗加樣孔2-3次,去除殘余的尿素。電泳槽內(nèi)外加入適量1×TBE緩沖液穩(wěn)壓200 V預(yù)電泳30分鐘。
注:試劑盒配套的10×TBE緩沖液僅夠配制凝膠用,1×TBE電泳緩沖液請(qǐng)自己制備,配方如下:
終濃度 |
順序 |
原料 |
1升 |
5 升 |
89 mM |
1 |
Tris堿 [MW121.14] |
10.8 克 |
54克 |
2 mM |
2 |
EDTA 2Na·2H2O [MW372.24] |
0.744 克 |
3.72克 |
89 MM |
3 |
硼酸 [MW61.83] |
5.5 克 |
27.5克 |
|
4 |
超純水最后定容至 |
1 升 |
5 升 |
|
|
最后pH在8.2-8.3之間,可以不用調(diào)節(jié)pH,記錄每批pH |
2.2. 取 3-5 μl樣品,加入等體積2×TBE尿素上樣緩沖液,70℃處理5 分鐘后立即冰浴,上樣。
2.3. 連接電源線,打開(kāi)電源開(kāi)關(guān),按照以下條件電泳。
|
恒電壓 |
起始電流 |
結(jié)束電流 |
電泳時(shí)間 |
適用條件 |
推薦電壓 |
200V |
15-20 mA/板膠 |
10-15 mA/板膠 |
60+ min |
最佳電壓,最優(yōu)的分辨率 |
2.4. 等待上樣緩沖液的溴酚藍(lán)指示前沿到凝膠底部時(shí)終止電泳,取出凝膠進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
變性膠濃度 |
溴酚藍(lán) |
二甲苯菁 |
5% |
35 nt |
130 nt |
8% |
19 nt |
75 nt |
10% |
15 nt |
55 nt |
15% |
10 nt |
52 nt |
三、染色:
3.1 單鏈DNA可以用單鏈DNA PAGE電泳染色試劑盒(貨號(hào):RTS5103),核酸PAGE電泳染色試劑盒(貨號(hào):RTS5102)或核酸快速銀染試劑盒(貨號(hào):RTS5101)進(jìn)行染色。
1. 使用單鏈DNA PAGE電泳染色試劑盒(貨號(hào):RTS5103)染色:
2. 使用核酸PAGE電泳染色試劑盒(貨號(hào):RTS5102)染色:
3. 使用RealSafe Red核酸染料(貨號(hào):GR002)染色:
4 使用核酸快速高靈敏度染色試劑盒(貨號(hào):RTS5101)染色:
使用RTE4102 DNA尿素PAGE電泳試劑盒 產(chǎn)品發(fā)表部分文章列表:
1. [2022 IF=9.23] Precision-SELEX aptamer
screening for the colorimetric and fluorescent dual-readout aptasensing of AFB
in food.
Author: Ying Li, Boyu Jia, Pengyue Song, Nan
Long, Linchun Shi, Peng Li, Jiabo Wang,Lidong Zhou, Weijun Kong
Product: RTE4102 DNA尿素PAGE電泳試劑盒
Journal: Food Chemistry 436 (2024) 137661
Institution:School of Traditional Chinese Medicine,
Capital Medical University
Paper link: https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2023.137661
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