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動(dòng)物核蛋白與胞漿蛋白提取試劑盒(組織樣品)
Animal Nuclear and Cytoplasmic Protein Extraction Kit for Tissues
產(chǎn)品貨號(hào) |
名稱 |
規(guī)格 |
RTD8303 |
動(dòng)物核蛋白與胞漿蛋白提取試劑盒(組織樣品) |
50 次 |
● 產(chǎn)品簡(jiǎn)介:
在研究細(xì)胞時(shí)經(jīng)常要研究細(xì)胞的不同組份,而研究得最多的兩個(gè)細(xì)胞組份就是細(xì)胞核和細(xì)胞漿。分離核蛋白和胞漿蛋白,不僅可以用于研究蛋白在細(xì)胞內(nèi)的定位,而且可以用于轉(zhuǎn)錄調(diào)控方面的研究,例如EMSA(也稱gel shift),footprinting等。動(dòng)物核蛋白與胞漿蛋白提取試劑盒(Animal Nuclear and Cytoplasmic Protein Extraction Kit)提供了一種比較簡(jiǎn)單方便地從組織中抽提細(xì)胞核蛋白與胞漿蛋白的方法。約90分鐘就可以完成組織細(xì)胞核蛋白與細(xì)胞漿蛋白的分離。抽提得到的蛋白可以用于Western,EMSA,footprinting,報(bào)告基因檢測(cè)以及酶活力測(cè)定等實(shí)驗(yàn)。
本試劑盒是通過裂解緩沖液在低滲透壓條件下,使細(xì)胞充分膨脹,破壞細(xì)胞膜,釋放出細(xì)胞漿蛋白,然后通過離心得到完整的細(xì)胞核(細(xì)胞核可以重懸于細(xì)胞核貯存緩沖液中 -80℃貯存);細(xì)胞核用核蛋白提取試劑I裂解,配合核酸酶Benzonase消化掉核酸,離心得到變性核蛋白;或者使用核蛋白提取試劑II裂解,離心得到非變性(活性)核蛋白。一般情況下,胞漿蛋白與核蛋白之間的交叉污染低于10%。
對(duì)于組織樣品,如果每個(gè)樣品的重量不超過50 mg,本試劑盒可以抽提50個(gè)樣品。
● 產(chǎn)品組成:
產(chǎn)品編號(hào) |
名稱 |
規(guī)格 |
貯存 |
RTD8303-01 |
裂解緩沖液A |
45 ml |
-20℃ |
RTD8303-02 |
裂解緩沖液B |
1 ml |
4 ℃ |
RTD8303-03 |
細(xì)胞核貯存緩沖液 |
0.5 ml |
-20℃ |
RTD8303-04 |
核蛋白提取試劑I(變性) |
5 ml |
-20℃ |
RTD8303-05 |
核蛋白提取試劑II(非變性) |
5 ml |
-20℃ |
RTD8303-06 |
臺(tái)盼藍(lán)染色液 |
0.5 ml |
4℃ |
PM1790S-01 |
PMSF溶液(100 mM) |
1 ml |
-20℃ |
RTT2106-01 |
Benzonase(250 U/μl) |
50 μl |
-20℃ |
DT0140P-01 |
1 M DTT |
1 ml |
4℃(配制后-20℃) |
● 貯存條件和運(yùn)輸:
根據(jù)標(biāo)簽溫度貯存;有效期一年;試劑盒濕冰運(yùn)輸。
● 用前必讀:
1. 離心機(jī)請(qǐng)調(diào)整成RCF/g模式,按照離心力設(shè)置離心機(jī)(不要根據(jù)轉(zhuǎn)速rpm模式設(shè)置),所有離心步驟都需要在4℃低溫離心機(jī)中進(jìn)行。
2. 蛋白提取推薦添加蛋白酶抑制劑,根據(jù)蛋白酶抑制劑母液濃度提前添加在蛋白提取溶液中(如抑制劑母液是 100×,添加時(shí)按照1:100添加)。研究蛋白磷酸化,需要添加磷酸酶抑制劑(自備,試劑盒不提供)。
3. 蛋白定量推薦使用BCA方法,可以選擇BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒(貨號(hào):RTP7102)。
● 使用方法:
一 胞漿蛋白和核蛋白的提?。?/b>
1.1準(zhǔn)備溶液:常溫溶解試劑盒中的試劑,溶解后立即放置在冰上,混勻。取適當(dāng)量的裂解緩沖液A,在使用前加入PMSF溶液和/或磷酸酶抑制劑(自備,試劑盒不提供)和1/1000體積的1 M DTT,隨后立即放于冰上待用。
組份 |
一次提取需要體積 |
PMSF溶液 |
1 M DTT |
Benzonase |
裂解緩沖液A (步驟1.2.2和1.3.1) |
800 μl |
8 μl |
0.8 μl |
- |
核蛋白提取試劑I(變性) (步驟1.4.1.2) |
100 μl |
1 μl |
0.1 μl |
1 μl |
核蛋白提取試劑II(非變性)(步驟1.4.2.2) |
50 μl |
0.5 μl |
- |
- |
1.2 組織胞漿蛋白提?。?
1.2.1把組織盡可能切成非常細(xì)小的碎片。
1.2.2按照每50 mg組織加入400 μl裂解緩沖液A(含抑制劑和DTT)的比例在玻璃勻漿器內(nèi)充分勻漿,勻漿需在冰浴進(jìn)行,勻漿后吸出勻漿液到離心管中,冰浴5分鐘。
1.2.3 關(guān)鍵步驟:加入20 μl裂解緩沖液B(按照裂解緩沖液A體積的1/20加入),混勻,冰浴5-10分鐘。
注1:此步驟盡量不要漩渦震蕩沉淀,否則得到的胞漿蛋白可能會(huì)污染核蛋白。
注2:裂解緩沖液對(duì)不同組織細(xì)胞的裂解能力有不同,敏感細(xì)胞裂解5分鐘足夠,其他細(xì)胞冰浴時(shí)間不要超過10分鐘。
1.2.4 4℃ 16000g 離心5分鐘,取80%上清即為胞漿蛋白,保存?zhèn)溆谩?
注:吸取上清時(shí)千萬不要觸及沉淀,可以只取80%體積上清,以免胞漿蛋白中污染細(xì)胞核。新鮮的肝臟組織用本產(chǎn)品裂解后獲得的上清,其胞漿蛋白濃度約為2-5 mg/ml,不同狀態(tài)的不同組織有所不同。
1.3 收集細(xì)胞核:
1.3.1 徹底去除步驟1.2.4離心管內(nèi)上清,沉淀中再次加入400 μl裂解緩沖液A(含PMSF
和DTT),用1 ml吸頭吹打重懸沉淀至沉淀完全散開(注:渦旋震蕩不易懸浮沉淀),冰浴5分鐘。
注:此步驟目的是徹底漂洗沉淀中殘余的未裂解細(xì)胞,可以大大提高細(xì)胞核的純度。
1.3.2 4℃ 16000g 離心5-10分鐘,徹底去除上清,沉淀即為完整的細(xì)胞核。
注:盡量完全把上清去除干凈,否則細(xì)胞核中會(huì)污染胞漿蛋白。
1.3.4 可選步驟:取10 μl細(xì)胞核溶液,加入10 μl臺(tái)盼藍(lán)染色液,混勻后,常溫放置2分鐘,顯微鏡下觀察細(xì)胞核的染色情況,提取良好的細(xì)胞核為均一藍(lán)色,沒有粘連(如圖)。
1.4 細(xì)胞核蛋白提取:
1.4.1 變性核蛋白提?。?/b>
注:此步驟使用含有SDS的核蛋白提取試劑I,完全裂解核膜,釋放出細(xì)胞核內(nèi)容物,提取的是完全變性的核蛋白,適用于SDS-PAGE電泳Western Blot檢測(cè)。
1.4.1.1 取一管50 μl細(xì)胞核溶液,4℃ 16000g 離心2分鐘,去除上清,保留沉淀。
1.4.1.2 沉淀中加入100 μl核蛋白提取試劑I(變性)(含PMSF和DTT)和1 μl Benzonase,吸頭重懸沉淀,37℃處理30分鐘至幾乎無可見不溶物。
注:加入核蛋白提取試劑I(變性)后,細(xì)胞核裂解釋放出大量核酸,溶液可能非常粘稠,核酸酶Benzonase可以消化掉核酸,降低粘度。
1.4.1.3 4℃16,000g離心10分鐘,立即吸取上清至一預(yù)冷的離心管中,即為抽提得到的變性核蛋白??梢粤⒓词褂?,也可以-80℃凍存。新鮮的50 mg肝臟組織用100 μl提取試劑I裂解后獲得的上清,可以使用BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒(貨號(hào):RTP7102)測(cè)定濃度,其核蛋白濃度約為1-3 μg/μl,不同細(xì)胞略有不同。
1.4.2 非變性核蛋白提取:
注:此步驟使用高鹽緩沖液(核蛋白提取試劑II)使得細(xì)胞核收縮,核酸結(jié)合蛋白(如轉(zhuǎn)錄因子)與核酸分離,擴(kuò)散到細(xì)胞核外部,離心后上清中為非變性(活性)核蛋白,適用EMSA,轉(zhuǎn)錄因子活性分析等實(shí)驗(yàn)。
1.4.2.1 取一管50 μl細(xì)胞核溶液,4℃ 16000g 離心2分鐘,去除上清,保留沉淀。
1.4.2.2 沉淀中加入50 μl核蛋白提取試劑II(非變性)(含PMSF,不要添加DTT),吸頭重懸沉淀,4℃旋轉(zhuǎn)混勻30 min,至最后得到的溶液無可見懸浮物。
注:如不能旋轉(zhuǎn)混勻,可以冰浴30 min,每隔5分鐘混勻一次。
1.4.2.3 4℃16,000g離心10分鐘,立即吸取上清至一預(yù)冷的離心管中,即為抽提得到的活性核蛋白??梢粤⒓词褂茫部梢?80℃凍存。新鮮的50 mg肝臟組織用50 μl提取試劑II裂解后獲得的上清,可以使用BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒(貨號(hào):RTP7102)測(cè)定濃度,其核蛋白濃度約為1-3 μg/μl,不同細(xì)胞略有不同。
二 關(guān)于胞漿蛋白和核蛋白產(chǎn)量和質(zhì)量的評(píng)價(jià):
2.1蛋白產(chǎn)量:
組織 |
組織重量 |
胞漿蛋白 |
核蛋白 |
腦 |
~50 mg |
~1.2 mg |
~70 μg |
肝臟 |
~50 mg |
~3.4 mg |
~80 μg |
心臟 |
~50 mg |
~1.6 mg |
~140 μg |
肺 |
~50 mg |
~1.5 mg |
~70 μg |
2.2 胞漿蛋白和核蛋白質(zhì)量評(píng)價(jià):
蛋白分區(qū)提取的質(zhì)量評(píng)價(jià)首先看提取的蛋白是否是分區(qū)蛋白,其次要看分區(qū)蛋白是否有明顯的富集,其三要看提出的分區(qū)蛋白是否有其他組分交叉污染,最后看提取的分區(qū)蛋白中是否可以檢測(cè)出目的蛋白。使用專門的胞漿內(nèi)參和細(xì)胞核內(nèi)參(下表),可以初步確認(rèn)提出的是胞漿蛋白還是核蛋白。蛋白是否有效富集需要用總蛋白作為對(duì)照,與總蛋白相比,胞漿蛋白內(nèi)參或核內(nèi)參是否有明顯富集。交叉污染可以用其他組分內(nèi)參檢測(cè)蛋白樣品,如關(guān)注胞漿蛋白中是否有細(xì)胞核蛋白污染,可以使用核蛋白內(nèi)參如Lamin B1檢測(cè)胞漿蛋白,檢測(cè)無條帶即說明胞漿蛋白與細(xì)胞核組分無交叉污染。用目標(biāo)蛋白抗體檢測(cè)分區(qū)蛋白,驗(yàn)證是否可以檢測(cè)到目的蛋白,蛋白大小是否符合預(yù)期。
位置 |
內(nèi)參名稱 |
大小 kD |
備注 |
胞漿蛋白內(nèi)參 |
GAPDH |
37 |
|
β-Actin |
45 |
|
|
β-Tubulin |
55 |
推薦 |
|
核內(nèi)參 |
Histone H3 |
17 |
H3出存在于細(xì)胞核內(nèi),也存在于線粒體中,胞漿中可以檢測(cè)到 |
PCNA |
36 |
|
|
Lamin B1 |
68 |
推薦 |
|